Microsoft acaba de presentar una nueva herramienta para descargar e instalar Windows 8.1. No lo he probado pero por lo que he leído hay que enchufar un USB, darle al botón Create Media y todos los archivos se descargan desde los servidores de Microsoft y al terminar el proceso te queda un USB booteable listo para instalar Windows 8.1
Create installation media for Windows 8.1 - Windows Help